凝胶迁移实验（EMSA）
凝胶迁移实验又称凝胶阻滞实验或电泳迁移率实验（Electrophoretic Mobility Shift Assay，EMSA），其原理基于蛋白-探针复合物在凝胶电泳过程中比对照组迁移更慢，是一种用于检测蛋白与核酸相互作用的技术。
背景说明
EMSA主要基于蛋白-探针复合物在在凝胶电泳过程中迁移较慢的原理。根据实验设计特异性和非特异性探针，当核酸探针与蛋白样本混合孵育时，样本中可以与核酸探针结合的蛋白质与探针形成蛋白-探针复合物，这种复合物由于分子量大，在进行PAGE电泳时迁移较慢，而没有结合蛋白的探针则迁移较快。孵育的样本在进行PAGE电泳并转膜后，蛋白-探针复合物会在膜靠前的位置形成一条带，说明有蛋白与目标探针发生互作。
图 EMSA基本原理示意图
服务流程
客户在线下单——订单/实验材料确认——实验设计——原核系统表达载体构建——蛋白纯化——合成探针——样品制备——配置非变性PAGE胶——电泳——转膜——交联——封闭——抗体孵育——洗涤显影——提交详细的实验报告
服务内容及说明
适用范围
1、用于研究DNA结合蛋白和特定的DNA序列的相互作用；
2、可用于DNA定性和定量分析；
3、用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。
凝胶迁移实验（EMSA）的优点
1、EMSA实验容易掌握，简单易行，要求的实验条件不苛刻，可以适应一定范围内的反应条件变动；
2、同位素标记探针具有非常短的半衰期并且对人的健康有害，而生物素标记更稳定、准确和方便，且亲和力高；
3、该技术可以检测的核酸分子大小和结构（单链、双链、三链、四链、环状核酸）范围很广；
4、在合适的条件下，在单个反应体系中就可以通过不同复合物的形成，检测不同蛋白与不同核酸分子之间的结合情况；
5、能检测的蛋白大小范围很广，从寡肽到转录因子复合物都能检测，并且该实验既可以使用纯蛋白也可以使用细胞提取物。
凝胶迁移实验（EMSA）的缺点
1、 无法衡量电泳过程中的化学平衡，在电泳过程中发生的快速解离会影响对复合物的检测；
2、在EMSA实验中，复合物的形成与许多因素有关，并不能直接反映分子大小或者鉴定复合物中的各种蛋白质；
3、EMSA实验不能提供蛋白结合在核酸上的准确序列位置；
4、EMSA在很大程度上属于定性实验，比如：可以检测蛋白-DNA复合物的形成与否，并不能精细的检测结合反应的上调或下调；
5、EMSA实验中并不考虑体内环境中影响蛋白DNA结合的因素，比如染色质的结构对复合物形成的影响，因此即使EMSA实验结果反映蛋白可以与DNA结合，在体内环境中也许还需要其它条件才能完成结合反应。
因此，EMSA适用于在初步研究蛋白与核酸相互作用时使用。
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：
1、与EMSA相关的目的基因与蛋白信息；
2、样品种属及类型；
3、其他与EMSA相关的信息。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告，检测结果可在线查看或打印，并永久保留。
实验交付内容
1、重组载体的全序列信息和注释信息；
2、重组载体的酶切图谱；
3、重组载体的测序结果；
4、重组载体：一份质粒、一份大肠杆菌菌液（25%甘油菌）；
(上述4点是客户需要构建载体，且客户自身需要才提供)
5、探针设计合成信息；
6、实验图片：原始蛋白纯化考染图及WB结果图；
7、实验报告。
案例展示
图 探针MYS1与蛋白GST-MYBS1有迁移条带，竞争型探针MYS1能够竞争掉部分探针MYS1与蛋白GST-MYBS1的迁移条带，突变型探针MYS1与蛋白GST-MYBS1没有迁移条带。
参考文献
Li W, Zhu Z, Chern M, et al. A Natural Allele of a Transcription Factor in Rice Confers Broad-Spectrum Blast Resistance.Cell. 2017;170(1):114-126.e15.
LaSarre B, Federle MJ. EMSA Analysis of DNA Binding By Rgg Proteins.Bio Protoc. 2013;3(15):e838.
Li W, Wang K, Chern M, et al. Sclerenchyma cell thickening through enhanced lignification induced by OsMYB30 prevents fungal penetration of rice leaves.New Phytol. 2020;226(6):1850-1863.